| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 参 | 松澤俊行 | 0:23:33 | 愛知教育大学16 |
| 1 | 柏村育郎 | 0:30:48 | 東北大学3 |
| 2 | 五嶋宏通 | 0:32:20 | 京都大学4 |
| 3 | 清水善郎 | 0:33:25 | 東北大学2 |
| 4 | 稲田元樹 | 0:40:00 | 立命館大学3 |
| 5 | 藤田啓明 | 0:40:23 | 京都橘大学2 |
| 6 | 斉藤優作 | 0:40:37 | 新潟大学2 |
| 7 | 高橋良寿 | 0:40:54 | 岩手県立大学2 |
| 8 | 若林孝行 | 0:41:00 | 立命館大学4 |
| 9 | 大浦宏記 | 0:41:16 | 京都大学2 |
| 10 | 野田徹 | 0:42:06 | 東北大学2 |
| 11 | 井上陽介 | 0:42:16 | 岩手大学4 |
| 12 | 友安充宜 | 0:42:28 | 東京工業大学4 |
| 13 | 富田康介 | 0:42:39 | 大阪大学2 |
| 14 | 千田浩介 | 0:42:52 | 東京工業大学2 |
| 15 | 西久保史明 | 0:43:43 | 東京大学3 |
| 16 | 篠塚高雅 | 0:46:47 | 神戸大学2 |
| 17 | 鈴木圭祐 | 0:46:52 | 茨城大学4 |
| 18 | 高木元輝 | 0:47:05 | 東京農工大学2 |
| 19 | 田中耕史 | 0:47:09 | 東京大学3 |
| 20 | 関愛允 | 0:47:32 | 東京農工大学2 |
| 21 | 渡辺敏喜 | 0:48:18 | 新潟大学3 |
| 22 | 高橋大輔 | 0:49:00 | 岩手大学3 |
| 23 | 岩崎慶士 | 0:50:55 | 東京農工大学2 |
| 24 | 早川崇 | 0:52:01 | 静岡大学2 |
| 25 | 高原誠 | 0:52:21 | 電気通信大学2 |
| 26 | 西山洋平 | 0:52:38 | 電気通信大学2 |
| 27 | 椛澤基史 | 0:53:16 | 千葉大学4 |
| 28 | 浅井貴弘 | 0:54:07 | 岩手大学4 |
| 29 | 瀧澤真一 | 0:54:12 | 北海道大学2 |
| 29 | 植山潔 | 0:54:12 | 関西大学2 |
| 31 | 福味亮仲 | 0:54:51 | 静岡大学4 |
| 32 | 伊藤隆博 | 0:55:14 | 東京農工大学2 |
| 33 | 大平幸央 | 0:55:15 | 東京工業大学2 |
| 33 | 大庭正裕 | 0:55:15 | 静岡大学4 |
| 35 | 四方田雄哉 | 0:55:30 | 静岡大学4 |
| 36 | 清水恭平 | 0:55:46 | 新潟大学4 |
| 37 | 永井成亮 | 0:55:50 | 東北大学3 |
| 参 | 高橋直樹 | 0:59:13 | 岩手大学5 |
| 38 | 伊藤洋平 | 0:59:24 | 静岡大学2 |
| 39 | 太田翔 | 1:00:55 | 東京農工大学4 |
| 40 | 佐野宏典 | 1:01:05 | 北海道大学2 |
| 41 | 坂田周哉 | 1:09:21 | 東京大学2 |
| 42 | 佐藤翔吾 | 1:10:33 | 筑波大学3 |
| 43 | 小出洋資 | 1:13:49 | 電気通信大学4 |
| 44 | 本間隆一 | 1:20:25 | 東京工業大学4 |
| 45 | 齋藤正敏 | 1:22:53 | 茨城大学4 |
| 46 | 佐藤哲平 | 1:32:42 | 山口大学2 |
| 47 | 高木雅史 | 1:43:22 | 電気通信大学2 |