| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 田村 陽祐 | 0:45:35 | 筑波大学2 |
| 2 | 牧山 知彦 | 0:45:48 | 東京大学3 |
| 3 | 一戸 康成 | 0:47:19 | 東北大学3 |
| 4 | 櫻木 伸也 | 0:48:11 | 静岡大学2 |
| 5 | 小林 恭輔 | 0:49:22 | 東北大学3 |
| 6 | 尾崎 高志 | 0:50:33 | 早稲田大学3 |
| 7 | 小柳 俊一郎 | 0:50:38 | 図書館情報大学3 |
| 8 | 厚主 敏治 | 0:50:53 | 図書館情報大学2 |
| 9 | 佐藤 嶺太 | 0:51:21 | 立命館大学3 |
| 10 | 石関 圭志 | 0:52:55 | 千葉大学4 |
| 11 | 西田 剛 | 0:54:03 | 東京大学2 |
| 12 | 田村 潔 | 0:54:28 | 新潟大学3 |
| 13 | 小田村 航 | 0:54:41 | 静岡大学3 |
| 14 | 中川 英一 | 0:55:27 | 京都大学3 |
| 15 | 安形 俊太郎 | 0:55:58 | 京都大学3 |
| 16 | 細田 北斗 | 0:56:01 | 岩手大学2 |
| 17 | 長谷川 洋徳 | 0:56:38 | 金沢大学4 |
| 18 | 北崎 茂 | 0:57:06 | 東京工業大学2 |
| 19 | 長沼 佑樹 | 0:57:50 | 京都大学3 |
| 20 | 佐藤 崇雄 | 0:57:57 | 静岡大学2 |
| 21 | 土肥 雅人 | 0:58:05 | 金沢大学2 |
| 22 | 守田 匡宏 | 0:58:10 | 京都大学4 |
| 23 | 竹内 瞬 | 0:58:15 | 東北大学3 |
| 24 | 真壁 浩之 | 0:58:41 | 大阪大学2 |
| 25 | 中澤 宏紀 | 0:58:52 | 金沢大学4 |
| 25 | 平岡 雅芸 | 0:58:52 | 金沢大学2 |
| 27 | 干場 祐 | 0:58:55 | 静岡大学2 |
| 28 | 後藤 俊介 | 0:58:59 | 千葉大学2 |
| 29 | 高橋 伸寧 | 0:59:17 | 慶應義塾大学2 |
| 29 | 原 昇司 | 0:59:17 | 大阪大学3 |
| 31 | 加登屋 毅 | 1:00:31 | 早稲田大学3 |
| 32 | 坂田 健一郎 | 1:01:12 | 千葉大学4 |
| 33 | 荒井 隆雄 | 1:01:53 | 東京農工大学2 |
| 34 | 石川 潤 | 1:02:36 | 東京大学2 |
| 35 | 北村 伸介 | 1:03:13 | 東京工業大学2 |
| 36 | 近藤 大樹 | 1:03:55 | 金沢大学2 |
| 37 | 深井 太志 | 1:03:56 | 千葉大学3 |
| 38 | 長澤 憲太郎 | 1:08:13 | 金沢大学3 |
| 39 | 中山 敏 | 1:09:11 | 大阪大学4 |
| 40 | 矢崎 賢治 | 1:09:13 | 静岡大学2 |
| 41 | 水越 悠文 | 1:10:50 | 京都大学3 |
| 42 | 前田 青 | 1:12:33 | 東京大学2 |
| 43 | 高橋 良英 | 1:12:57 | 東京農工大学3 |
| 44 | 加賀 千晶 | 1:14:20 | 名古屋大学4 |
| 45 | 寺嶋 健太 | 1:15:51 | 新潟大学3 |
| 46 | 若宮 武 | 1:21:51 | 大阪外国語大学3 |
| 47 | 中村 洋輔 | 1:22:49 | 静岡大学4 |
| 48 | 名木山 滋 | 1:23:34 | 大阪市立大学2 |
| 49 | 加藤 真基 | 1:25:45 | 京都大学2 |
| 50 | 織田 勝久 | 1:33:15 | 中央大学2 |
| 51 | 高橋 直樹 | 1:34:28 | 岩手大学2 |
| 52 | 上田 隆之 | 1:35:15 | 大阪市立大学4 |
| 53 | 赤地 祐彦 | 1:35:23 | 名古屋大学2 |
| 54 | 小野木 哲也 | 1:35:27 | 東北大学3 |
| 55 | 上田 篤史 | 1:36:35 | 京都大学2 |
| 56 | 石川 浩久 | 1:38:47 | 千葉大学2 |
| 57 | 宜保 諒 | 1:44:45 | 大阪大学3 |
| 58 | 林田 拓也 | 1:46:10 | 山口大学3 |
| 59 | 下山 真和 | 1:52:19 | 中央大学2 |
| 60 | 井上 勇樹 | 1:57:16 | 大阪市立大学2 |
| 大浅 殖央 | DISQ | 東京農工大学3 | |
| 野口 喜朗 | DISQ | 金沢大学2 | |
| 松倉 淳 | DISQ | 電気通信大学2 | |
| 鷹觜 和邦 | DISQ | 東京工業大学3 | |
| 大谷 周平 | DISQ | 大阪市立大学2 | |
| 原田 圭一郎 | DISQ | 大阪大学3 | |
| 櫻井 良亮 | DISQ | 大阪市立大学3 | |
| 武藤 広晃 | DISQ | 名古屋大学2 | |
| 鎌田 裕一 | DISQ | 電気通信大学2 | |
| 天兒 英二 | DISQ | 新潟大学4 | |
| 椛島 伸也 | DISQ | 京都大学2 |