| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 神谷 泰介 | 0:13:48 | 筑波大学 |
| 2 | 三森 創一朗 | 0:14:12 | 東北大学 |
| 3 | 栄森 貴久 | 0:14:29 | 京都大学 |
| 4 | 大木 孝 | 0:14:37 | 東京大学 |
| 5 | 田仲 圭 | 0:15:09 | 新潟大学 |
| 6 | 岡本 将志 | 0:15:19 | 早稲田大学 |
| 6 | 中井 智規 | 0:15:19 | 東北大学 |
| 8 | 市脇 翔平 | 0:15:53 | 京都大学 |
| 9 | 更科 裕介 | 0:15:55 | 新潟大学 |
| 9 | 鈴木 周(高校) | 0:15:55 | 東海高校 |
| 11 | 梶谷 周平 | 0:16:07 | 東北大学 |
| 12 | 鵜瀬 和秀 | 0:16:11 | 名古屋大学 |
| 12 | 山本 剛史 | 0:16:11 | 東京工業大学 |
| 14 | 太田 瑛佑 | 0:16:36 | 早稲田大学 |
| 15 | 松矢 將太郎 | 0:16:55 | 京都大学 |
| 16 | 新見 哲也 | 0:17:39 | 早稲田大学 |
| 17 | 中村 憲 | 0:17:55 | 東北大学 |
| 18 | 山中 晴揮(高校) | 0:17:58 | 東海高校 |
| 19 | 宮内 貴規 | 0:18:22 | 静岡大学 |
| 20 | 藤井 通太 | 0:18:25 | 東京工業大学 |
| 21 | 吉谷 浩平 | 0:18:42 | 東北大学 |
| 22 | 石松 純 | 0:18:49 | 筑波大学 |
| 23 | 石田 英己 | 0:18:51 | 新潟大学 |
| 24 | 水野 佳本 | 0:18:52 | 新潟大学 |
| 25 | 平井 皓基(高校) | 0:18:57 | 東海高校 |
| 26 | 翁川 竜海(高校) | 0:19:07 | 武相高校 |
| 27 | 大津 勇輝 | 0:19:20 | 新潟大学 |
| 28 | 西名 慧史 | 0:19:38 | 茨城大学 |
| 29 | 五十嵐 拓実 | 0:21:18 | 新潟大学 |
| 30 | 横田 塁 | 0:21:34 | 岩手大学 |
| 31 | 近藤 準 | 0:25:09 | 茨城大学 |
| 32 | 今井 友之 | 0:27:22 | 新潟大学 |
| 33 | 新美 宏樹 | 0:31:38 | 静岡大学 |
| 石井 涼大 | DISQ | 新潟大学 | |
| 杣 俊範 | DISQ | 北海道大学 | |
| 二階堂 晋作 | DISQ | 新潟大学 | |
| 藤島 陽平 | DISQ | 北海道大学 | |
| 石黒 裕將 | DISQ | 岩手大学 | |
| 齋藤 遼一 | DISQ | 東北大学 |