| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 豊田 伸平 | 0:44:55 | 東京大学 |
| 2 | 薗部 駿太 | 0:45:13 | 東北大学 |
| 3 | 森元 駿介 | 0:45:42 | 横浜国立大学 |
| 4 | 渡辺 鷹志 | 0:46:30 | 慶応義塾大学 |
| 5 | 瀧下真一 | 0:46:38 | 静岡大学 |
| 6 | 倉地 草太 | 0:47:33 | 北海道大学 |
| 7 | 三好 将史 | 0:48:21 | 早稲田大学 |
| 8 | 種澤 遼太郎 | 0:48:31 | 東北大学 |
| 9 | 高見澤 翔一 | 0:48:38 | 一橋大学 |
| 10 | 唐木 朋也 | 0:48:46 | 東北大学 |
| 11 | 外石 裕太郎 | 0:49:15 | 新潟大学 |
| 12 | 髙本 育弥 | 0:49:35 | 東北大学 |
| 13 | 吉岡 英晃 | 0:51:33 | 京都大学 |
| 14 | 比企野 純一 | 0:51:43 | 東京大学 |
| 15 | 五十嵐 央人 | 0:52:13 | 金沢大学 |
| 16 | 根本 夏林 | 0:52:59 | 東京大学 |
| 17 | 堀江 直人 | 0:53:20 | 東北大学 |
| 18 | 石渡 望 | 0:53:21 | 東北大学 |
| 19 | 上野 渉 | 0:55:20 | 東北大学 |
| 20 | 浜野 奎 | 0:55:37 | 慶応義塾大学 |
| 21 | 小川 一真 | 0:56:18 | 早稲田大学 |
| 22 | 八重樫 篤矢 | 0:57:23 | 東北大学 |
| 23 | 島田 雄二 | 0:57:25 | 東京工業大学 |
| 24 | 桃本一輝 | 0:57:37 | 大阪大学 |
| 25 | 鈴木 京佑 | 0:57:44 | 横浜市立大学 |
| 26 | 三瀬 遼太郎 | 0:57:55 | 早稲田大学 |
| 27 | 谷平 光一 | 0:58:40 | 名古屋大学 |
| 28 | 石森 晃 | 0:59:04 | 東北大学 |
| 29 | 鈴木 皓紀 | 0:59:48 | 新潟大学 |
| 30 | 田中 陽祐 | 1:00:07 | 京都大学 |
| 31 | 小平 修 | 1:00:21 | 東北大学 |
| 32 | 得能 渉 | 1:00:26 | 千葉大学 |
| 33 | 土井 一輝 | 1:00:53 | 新潟大学 |
| 34 | 茶谷 知哉 | 1:00:57 | 名古屋大学 |
| 35 | 吉原 幸輝 | 1:00:59 | 大阪大学 |
| 35 | 戸澤 貴志 | 1:00:59 | 横浜国立大学 |
| 37 | 澤入圭司 | 1:01:23 | 静岡大学 |
| 38 | 濱口 広 | 1:01:56 | 新潟大学 |
| 39 | 佐藤 公洋 | 1:02:27 | 東京大学 |
| 40 | 大倉 崚吾 | 1:02:28 | 東京工業大学 |
| 41 | 上村 太城 | 1:02:35 | 慶応義塾大学 |
| 42 | 斎藤 滉弥 | 1:03:03 | 東北大学 |
| 43 | 佐藤 太一 | 1:03:14 | 新潟大学 |
| 44 | 石田 健太郎 | 1:03:38 | 早稲田大学 |
| 45 | 佐藤 世帆 | 1:04:24 | 岩手大学 |
| 46 | 冨田 智司 | 1:04:34 | 新潟大学 |
| 47 | 河合 郁弥 | 1:04:44 | 京都大学 |
| 48 | 尾山 直駿 | 1:04:56 | 東京工業大学 |
| 49 | 本田明良 | 1:05:24 | 静岡大学 |
| 50 | 山川 登 | 1:05:30 | 東京大学 |
| 51 | 米沢 嘉彦 | 1:05:53 | 千葉大学 |
| 52 | 白旗 洸太 | 1:07:19 | 北海道大学 |
| 53 | 菅野 裕貴 | 1:07:28 | 横浜市立大学 |
| 54 | 柏田 芳樹 | 1:07:47 | 一橋大学 |
| 55 | 宇佐美明秀 | 1:08:44 | 静岡大学 |
| 56 | 佐藤 和真 | 1:09:11 | 神戸大学 |
| 57 | 清水 慎太郎 | 1:09:12 | 広島大学 |
| 58 | 瀬領 勇司 | 1:09:36 | 京都大学 |
| 59 | 窪田信司 | 1:09:38 | 大阪大学 |
| 60 | 柳 康太 | 1:10:48 | 東京工業大学 |
| 61 | 後藤 幸大 | 1:11:03 | 東京大学 |
| 62 | 熊谷 新吉 | 1:11:09 | 岩手大学 |
| 63 | 吉田 輝 | 1:11:40 | 新潟大学 |
| 64 | 山下 政泰 | 1:12:01 | 新潟大学 |
| 65 | 高松 涼 | 1:12:07 | 福島大学 |
| 66 | 佐藤 健斗 | 1:12:10 | 横浜国立大学 |
| 67 | 伊村 公志 | 1:12:22 | 名古屋大学 |
| 68 | 荒井 純 | 1:12:32 | 東北大学 |
| 69 | 二瓶 勢真 | 1:13:21 | 金沢大学 |
| 70 | 七五三碧 | 1:13:32 | 茨城大学 |
| 71 | 大橋 遼 | 1:14:37 | 早稲田大学 |
| 72 | 高野 陽平 | 1:14:40 | 神戸大学 |
| 73 | 熊谷 隼 | 1:14:54 | 北海道大学 |
| 74 | 青野 綾介 | 1:15:39 | 筑波大学 |
| 75 | 安達 郁哉 | 1:16:05 | 筑波大学 |
| 76 | 西村 肇倫 | 1:17:18 | 東北大学 |
| 77 | 岩佐 一大 | 1:17:20 | 千葉大学 |
| 78 | 藤田 純矢 | 1:17:55 | 東京工業大学 |
| 79 | 木下 雄大 | 1:19:37 | 京都大学 |
| 80 | 田口 滉一 | 1:21:34 | 東京工業大学 |
| 81 | 渡邊 駿太 | 1:23:02 | 新潟大学 |
| 82 | 森田 涼介 | 1:23:09 | 名古屋大学 |
| 83 | 中村 直暉 | 1:23:50 | 横浜国立大学 |
| 84 | 室谷 拓冶 | 1:27:41 | 東北大学 |
| 85 | 岡田 翔太 | 1:28:07 | 千葉大学 |
| 86 | 大屋 和貴 | 1:31:30 | 東京工業大学 |
| 87 | 池田 順一 | 1:34:22 | 神戸大学 |
| 88 | 鎌田 和希 | 1:38:19 | 新潟大学 |
| 89 | 今井 雅啓 | 1:39:54 | 北海道大学 |
| 90 | 木下 達仁 | 1:42:27 | 一橋大学 |
| 91 | 山越 広登 | 1:46:51 | 金沢大学 |
| 92 | 奥脇琢朗 | 1:54:57 | 新潟大学 |
| 93 | 飛島 寛人 | 1:57:20 | 東京大学 |
| 関戸 一樹 | DISQ | 横浜国立大学 | |
| 村本 周平 | DISQ | 京都大学 | |
| 小松 宗一郎 | DISQ | 新潟大学 |