| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 高橋 元気 | 0:38:07 | 東北大学1 |
| 2 | 田村 陽祐 | 0:38:30 | 筑波大学1 |
| 3 | 角幡 原太 | 0:39:09 | 慶應義塾大学1 |
| 4 | 後藤 大輔 | 0:39:26 | 東北大学1 |
| 5 | 櫻木 伸也 | 0:39:43 | 静岡大学1 |
| 6 | 池 陽平 | 0:42:36 | 北海道大学1 |
| 7 | 川嶋 宗一郎 | 0:44:22 | 北海道大学1 |
| 8 | 大塚 紘史 | 0:44:35 | 千葉大学1 |
| 9 | 山田 祐嗣 | 0:45:55 | 名古屋大学1 |
| 10 | 菊池 武 | 0:47:10 | 東京大学1 |
| 11 | 仲村 健一 | 0:47:11 | 京都大学1 |
| 12 | 佐藤 崇雄 | 0:47:26 | 静岡大学1 |
| 13 | 北村 伸介 | 0:47:42 | 東京工業大学1 |
| 14 | 青木 邦俊 | 0:48:00 | 静岡大学1 |
| 15 | 高橋 伸寧 | 0:49:55 | 慶應義塾大学1 |
| 16 | 土肥 雅人 | 0:51:48 | 金沢大学1 |
| 17 | 後藤 俊介 | 0:52:17 | 千葉大学1 |
| 18 | 山口 能迪 | 0:53:26 | 東京大学1 |
| 19 | 永井 雄一郎 | 0:53:34 | 慶應義塾大学1 |
| 20 | 植村 圭祐 | 0:56:54 | 東京大学1 |
| 21 | 岩井 稔 | 0:57:37 | 早稲田大学1 |
| 22 | 小森 康孝 | 0:57:43 | 金沢大学1 |
| 23 | 今野 利光 | 0:57:52 | 東京工業大学1 |
| 24 | 鎌田 憲幸 | 1:00:21 | 岩手大学1 |
| 25 | 三上 諒 | 1:01:59 | 岩手大学1 |
| 26 | 保前 保 | 1:02:08 | 千葉大学1 |
| 27 | 伊藤 善人 | 1:02:12 | 東京工業大学1 |
| 28 | 鶴井 達也 | 1:03:29 | 名古屋大学1 |
| 29 | 下山 真和 | 1:04:12 | 中央大学1 |
| 30 | 野田 秀俊 | 1:05:12 | 東京大学1 |
| 31 | 水石 和秀 | 1:07:30 | 大阪市立大学1 |
| 32 | 石川 浩久 | 1:07:59 | 千葉大学1 |
| 33 | 大下 理史 | 1:08:50 | 山口大学1 |
| 34 | 不破 喬 | 1:10:39 | 東京農工大学1 |
| 35 | 山口 直哉 | 1:10:42 | 静岡大学1 |
| 36 | 東口 晴一 | 1:13:05 | 東京農業大学1 |
| 37 | 市川 祥広 | 1:14:03 | 図書館情報大学1 |
| 38 | 香川 譲徳 | 1:14:10 | 東京農工大学1 |
| 39 | 武藤 広晃 | 1:15:48 | 名古屋大学1 |
| 39 | 佐藤 祐樹 | 1:15:48 | 茨城大学1 |
| 41 | 北村 俊介 | 1:18:58 | 東京工業大学1 |
| 42 | 赤地 祐彦 | 1:20:20 | 名古屋大学1 |
| 43 | 西本 大夢 | 1:21:28 | 大阪大学1 |
| 44 | 室川 紘一 | 1:24:07 | 新潟大学1 |
| 45 | 米田 稔 | 1:24:41 | 大阪市立大学1 |
| 46 | 園原 揚介 | 1:27:25 | 静岡大学1 |
| 47 | 岡本 正光 | 1:30:00 | 千葉大学1 |
| 48 | 原野 剛 | 1:30:22 | 山口大学1 |
| 49 | 永松 敦 | 1:32:04 | 北海道大学1 |
| 50 | 松尾 大道 | 1:32:26 | 山口大学1 |
| 51 | 石角 直大 | 1:33:05 | 京都大学1 |
| 52 | 鶴田 翔一 | 1:33:54 | 金沢大学1 |
| 53 | 東條 靖 | 1:36:37 | 静岡大学1 |
| 54 | 水戸部 一貴 | 1:37:28 | 電気通信大学1 |
| 55 | 綾部 孝 | 1:39:28 | 茨城大学1 |
| 56 | 清塚 大輔 | 1:39:49 | 金沢大学1 |
| 57 | 井上 勇樹 | 1:42:53 | 大阪市立大学1 |
| 58 | 尾崎 友昭 | 1:51:25 | 中央大学1 |
| 59 | 櫻井 悠 | 1:53:00 | 岩手大学1 |
| 野口 喜朗 | DISQ | 金沢大学1 | |
| 新田 潤一郎 | DISQ | 金沢大学1 | |
| 依田 隆 | DISQ | 千葉大学1 | |
| 斎藤 将孝 | DISQ | 山口大学1 | |
| 久野 優志 | DISQ | 山口大学1 | |
| 森實 剛史 | DISQ | 東京農業大学1 | |
| 窪田 和博 | DISQ | 埼玉大学1 | |
| 福西 展之 | DISQ | 立命館大学1 | |
| 椛島 伸也 | DISQ | 京都大学1 | |
| 鎌田 裕一 | DISQ | 電気通信大学1 | |
| 平尾 正明 | DISQ | 電気通信大学1 | |
| 大谷 周平 | DISQ | 大阪市立大学1 | |
| 藤田 靖 | DISQ | 山口大学1 |