| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 小林 隆昭 | 0:36:49 | 千葉大学1 |
| 2 | 西山 晃 | 0:40:49 | 東京農工大学1 |
| 3 | 西田 剛志 | 0:41:20 | 東京大学1 |
| 4 | 樽見 典明 | 0:42:46 | 名古屋大学1 |
| 5 | 今井 直樹 | 0:45:06 | 早稲田大学1 |
| 6 | 木平 孝和 | 0:45:13 | 東京工業大学1 |
| 7 | 及川 弘文 | 0:47:08 | 岩手大学1 |
| 8 | 村上 諒一 | 0:47:09 | 東京工業大学1 |
| 9 | 松井 弘之 | 0:47:43 | 東京大学1 |
| 10 | 高田 智実 | 0:48:38 | 京都大学1 |
| 11 | 市川 佑樹 | 0:48:54 | 東北大学1 |
| 12 | 井口 弘章 | 0:49:44 | 東北大学1 |
| 13 | 西山 洋生 | 0:50:38 | 静岡大学1 |
| 14 | 清水 陽太 | 0:50:45 | 早稲田大学1 |
| 15 | 渡辺 雅敏 | 0:51:24 | 静岡大学1 |
| 16 | 厚主 敏治 | 0:52:03 | 図書館情報大学1 |
| 17 | 弾塚 康平 | 0:52:10 | 東京農工大学1 |
| 18 | 細田 北斗 | 0:52:18 | 岩手大学1 |
| 19 | 石井 大生 | 0:52:56 | 東京都立大学1 |
| 20 | 矢崎 賢治 | 0:53:49 | 静岡大学1 |
| 21 | 田口 裕也 | 0:54:44 | 茨城大学1 |
| 22 | 京相 健二 | 0:56:00 | 茨城大学1 |
| 23 | 上田 達也 | 0:56:22 | 大阪大学1 |
| 24 | 岡 英樹 | 0:56:33 | 東京工業大学1 |
| 25 | 高橋 雄哉 | 0:56:43 | 図書館情報大学1 |
| 26 | 谷田 慎也 | 0:57:17 | 京都大学1 |
| 27 | 古川 康之 | 0:57:34 | 大阪大学1 |
| 28 | 持丸 智英 | 1:00:28 | 千葉大学1 |
| 29 | 村上 尭 | 1:00:54 | 神戸大学1 |
| 30 | 馬場 政志 | 1:01:56 | 大阪大学1 |
| 31 | 笹倉 拓人 | 1:01:58 | 神戸大学1 |
| 31 | 加藤 真基 | 1:01:58 | 京都大学1 |
| 33 | 干場 祐 | 1:04:07 | 静岡大学1 |
| 34 | 清藤 祐三 | 1:04:51 | 国際基督教大学1 |
| 35 | 赤木 孝信 | 1:07:55 | 立命館大学1 |
| 36 | 北崎 茂 | 1:07:56 | 東京工業大学1 |
| 37 | 八重樫 優一 | 1:09:20 | 千葉大学1 |
| 38 | 名木山 滋 | 1:10:06 | 大阪市立大学1 |
| 39 | 渡辺 徹 | 1:10:40 | 静岡大学1 |
| 40 | 近藤 大樹 | 1:12:06 | 金沢大学1 |
| 41 | 荒井 隆雄 | 1:13:26 | 東京農工大学1 |
| 42 | 平岡 雅芸 | 1:13:28 | 金沢大学1 |
| 43 | 吉川 直人 | 1:13:51 | 電気通信大学1 |
| 44 | 上田 篤史 | 1:14:18 | 京都大学1 |
| 45 | 青山 文生 | 1:14:52 | 岩手大学1 |
| 46 | 鎌田 健太郎 | 1:16:25 | 新潟大学1 |
| 47 | 真壁 浩之 | 1:16:33 | 大阪大学1 |
| 48 | 藤井 美岳 | 1:16:54 | 静岡大学1 |
| 49 | 石母田 篤 | 1:16:56 | 茨城大学1 |
| 50 | 海野 正英 | 1:17:14 | 東京工業大学1 |
| 51 | 宮川 純一 | 1:18:10 | 筑波大学1 |
| 52 | 猿渡 洋介 | 1:19:42 | 京都大学1 |
| 53 | 森 英敏 | 1:19:48 | 静岡大学1 |
| 54 | 下村 英雄 | 1:20:56 | 茨城大学1 |
| 55 | 水野 崇行 | 1:26:46 | 千葉大学1 |
| 56 | 鎌田 政光 | 1:28:00 | 大東文化大学1 |
| 57 | 下川 丈明 | 1:33:10 | 京都大学1 |
| 58 | 石川 潤 | 1:33:51 | 東京大学1 |
| 59 | 佐藤 郷 | 1:34:00 | 筑波大学1 |
| 60 | 阪戸 慎一 | 1:37:27 | 金沢大学1 |
| 61 | 西岡 英則 | 1:39:52 | 名古屋大学1 |
| 62 | 関 義隆 | 1:41:35 | 国際基督教大学1 |
| 63 | 長谷川 博之 | 1:47:47 | 電気通信大学1 |
| 64 | 橘 俊也 | 1:54:33 | 電気通信大学1 |
| 65 | 萩原 慶太 | 1:56:26 | 神戸大学1 |
| 66 | 長野 祐一 | 1:56:38 | 東京大学1 |
| 角谷 啓延 | DISQ | 大東文化大学1 | |
| 伊藤 大輔 | DISQ | 岩手大学1 | |
| 織田 勝久 | DISQ | 中央大学1 | |
| 君塚 晃平 | DISQ | 埼玉大学1 | |
| 武田 順一 | DISQ | 電気通信大学1 | |
| 近藤 崇 | DISQ | 中央大学1 | |
| 松倉 淳 | DISQ | 電気通信大学1 |