| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 林 泰斗 | 0:42:18 | 東北大学 2 |
| 2 | 佐藤 啓史 | 0:45:31 | 東京大学 3 |
| 代 | 青柳 健大 | 0:47:37 | |
| 3 | 丹羽 史尋 | 0:48:55 | 東京大学 3 |
| 4 | 登坂 祥大 | 0:49:17 | 慶應義塾大学 3 |
| 5 | 神山 康 | 0:49:45 | 早稲田大学 2 |
| 6 | 三上 諒 | 0:50:19 | 岩手大学 4 |
| 7 | 仲村 健一 | 0:50:23 | 京都大学 4 |
| 8 | 渡辺 裕己 | 0:50:30 | 東京大学 3 |
| 9 | 佐々木 崇 | 0:50:59 | 新潟大学 2 |
| 9 | 荒川 渓 | 0:50:59 | 東京大学 3 |
| 11 | 足立 恭兵 | 0:51:01 | 慶應義塾大学 2 |
| 12 | 佐藤 崇雄 | 0:51:07 | 静岡大学 4 |
| 13 | 高田 英司 | 0:52:10 | 東北大学 3 |
| 14 | 大杉 祥二 | 0:52:12 | 筑波大学 2 |
| 15 | 関谷 茂樹 | 0:52:13 | 東北大学 4 |
| 16 | 宮澤 直樹 | 0:52:14 | 東京農工大学 3 |
| 16 | 前田 肇 | 0:52:14 | 東京大学 2 |
| 18 | 八神 遥介 | 0:52:20 | 東北大学 3 |
| 19 | 小川 圭介 | 0:52:49 | 慶應義塾大学 3 |
| 20 | 佐藤 郷 | 0:53:46 | 筑波大学 4 |
| 21 | 岩城 徹 | 0:54:31 | 東北大学 3 |
| 22 | 廣崎 旭宏 | 0:54:37 | 東北大学 3 |
| 23 | 松井 弘毅 | 0:56:15 | 東京工業大学 3 |
| 24 | 並木 政憲 | 0:56:56 | 筑波大学 2 |
| 25 | 谷 直樹 | 0:57:09 | 龍谷大学 3 |
| 26 | 西久保 史明 | 0:57:13 | 東京大学 2 |
| 27 | 福田 重一 | 0:57:18 | 岩手大学 3 |
| 28 | 手塚 宙之 | 0:57:25 | 慶應義塾大学 2 |
| 29 | 山崎 啓吾 | 0:57:32 | 東京工業大学 2 |
| 30 | 仲田 貴幸 | 0:58:02 | 関西大学 2 |
| 31 | 吉田 知峻 | 0:58:07 | 東京大学 2 |
| 32 | 小松田 成幸 | 0:58:38 | 岩手大学 3 |
| 33 | 緑川 拓也 | 0:58:46 | 新潟大学 2 |
| 34 | 天笠 真吾 | 0:58:57 | 金沢大学 3 |
| 35 | 落合 剛 | 1:00:00 | 埼玉大学 3 |
| 36 | 尾崎 健士 | 1:00:36 | 千葉大学 3 |
| 37 | 吉野 信 | 1:01:11 | 京都大学 3 |
| 38 | 稲垣 孝宣 | 1:01:40 | 京都大学 2 |
| 39 | 松井 弘之 | 1:01:58 | 東京大学 4 |
| 40 | 中 清行 | 1:02:10 | 神戸大学 2 |
| 41 | 岩瀬 祐介 | 1:02:36 | 早稲田大学 2 |
| 42 | 男庭 和則 | 1:02:50 | 茨城大学 2 |
| 43 | 佐藤 嵩浩 | 1:03:09 | 早稲田大学 3 |
| 44 | 石川 潤 | 1:04:12 | 東京大学 4 |
| 45 | 青木 邦俊 | 1:05:13 | 静岡大学 4 |
| 46 | 近藤 大樹 | 1:05:34 | 金沢大学 4 |
| 47 | 福味 亮仲 | 1:05:39 | 静岡大学 3 |
| 48 | 上田 篤史 | 1:06:43 | 京都大学 4 |
| 49 | 井上 陽介 | 1:06:54 | 岩手大学 3 |
| 50 | 下村 英雄 | 1:06:55 | 茨城大学 4 |
| 51 | 川名 聡 | 1:08:12 | 横浜国立大学 2 |
| 52 | 湯沢 友豪 | 1:08:16 | 東北大学 3 |
| 53 | 井口 弘章 | 1:08:58 | 東北大学 4 |
| 54 | 田沢 典彦 | 1:10:00 | 東京工業大学 2 |
| 55 | 成田 充 | 1:11:00 | 図書館情報大学 5 |
| 56 | 赤地 祐彦 | 1:13:56 | 名古屋大学 4 |
| 57 | 馬場 政志 | 1:13:58 | 大阪大学 4 |
| 58 | 大橋 洋介 | 1:14:25 | 慶應義塾大学 2 |
| 59 | 濱崎 嘉久 | 1:14:33 | 静岡大学 3 |
| 60 | 那須野 勇人 | 1:17:14 | 静岡大学 2 |
| 61 | 酒井 伸也 | 1:21:03 | 東北大学 3 |
| 62 | 飯塚 祥太 | 1:21:06 | 新潟大学 2 |
| 63 | 稲田 元樹 | 1:21:52 | 立命館大学 2 |
| 64 | 景山 健 | 1:23:57 | 早稲田大学 2 |
| 65 | 南部 壮志 | 1:26:28 | 神戸大学 2 |
| 66 | 松田 康彦 | 1:27:40 | 金沢大学 3 |
| 67 | 野村 佳祐 | 1:28:58 | 東京工業大学 2 |
| 68 | 若林 宗平 | 1:29:07 | 北海道大学 3 |
| 69 | 柴崎 洋志 | 1:29:11 | 山口大学 3 |
| 70 | 土井 理司 | 1:29:25 | 静岡大学 2 |
| 71 | 高橋 直樹 | 1:29:30 | 岩手大学 4 |
| 72 | 小野原 翔 | 1:30:31 | 立命館大学 2 |
| 73 | 岩井 俊樹 | 1:35:46 | 静岡大学 3 |
| 74 | 浅井 貴弘 | 1:45:12 | 岩手大学 3 |
| 75 | 石坂 仁 | 1:58:02 | 千葉大学 2 |
| 小森 康孝 | DISQ | 金沢大学 4 | |
| 横山 恵司 | DISQ | 東京農工大学 2 | |
| 佐藤 雅則 | DISQ | 新潟大学 4 | |
| 川崎 健志 | DISQ | 東北大学 2 | |
| 三輪 暁人 | DISQ | 茨城大学 2 | |
| 若林 考行 | DISQ | 立命館大学 3 |