| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 瀧川英雄 | 1:35:16 | 神戸 |
| 2 | 広江淳良 | 1:40:15 | 東京 |
| 3 | 丸山哲史 | 1:43:07 | 日本体育 |
| 4 | 竹内藤雄 | 1:44:36 | 東京農工 |
| 5 | 柳澤貴 | 1:45:51 | 千葉 |
| 6 | 泉通博 | 1:46:30 | 東京 |
| 7 | 植竹康朋 | 1:50:32 | 筑波 |
| 8 | 白戸秀和 | 1:53:49 | 早稲田 |
| 9 | 伊藤史朗 | 1:53:51 | 東京 |
| 10 | 井上健太郎 | 1:55:44 | 大阪 |
| 11 | 広瀬一郎 | 1:57:55 | 東京 |
| 12 | 大嶽俊秀 | 1:58:00 | 東京学芸 |
| 13 | 大佐欣也 | 1:58:47 | 東京 |
| 14 | 田代雅之 | 1:58:57 | 横浜国立 |
| 15 | 山本知宏 | 1:59:40 | 千葉 |
| 16 | 飯山春樹 | 2:00:41 | 早稲田 |
| 17 | 草野定一 | 2:01:07 | 千葉 |
| 18 | 小泉辰喜 | 2:01:08 | 慶應義塾 |
| 19 | 佐藤信彦 | 2:01:56 | 東京 |
| 20 | 太田尊司 | 2:02:14 | 広島 |
| 21 | 斉藤文夫 | 2:02:22 | 千葉 |
| 22 | 上島通浩 | 2:03:20 | 東北 |
| 23 | 稲垣智彦 | 2:04:22 | 筑波 |
| 24 | 金沢仁 | 2:05:49 | 京都 |
| 25 | 橋本裕志 | 2:06:33 | 神戸 |
| 26 | 金田浩 | 2:07:16 | 横浜国立 |
| 27 | 篠崎東雄 | 2:08:16 | 早稲田 |
| 28 | 玉木圭介 | 2:08:31 | 大阪 |
| 29 | 平井均 | 2:09:25 | 静岡 |
| 30 | 浜崎篤 | 2:11:10 | 広島 |
| 31 | 萩原淳 | 2:12:06 | 東北 |
| 31 | 松山淳 | 2:12:06 | 静岡 |
| 33 | 吉野信治 | 2:12:56 | 静岡 |
| 34 | 山本靖 | 2:13:58 | 大阪 |
| 35 | 澤田晴雄 | 2:15:54 | 東京農業 |
| 36 | 戸田淳 | 2:16:02 | 東京 |
| 37 | 永元真也 | 2:16:03 | 東京農工 |
| 38 | 三谷洋一 | 2:16:09 | 大阪 |
| 39 | 鈴木康史 | 2:17:14 | 京都 |
| 40 | 金田修 | 2:18:57 | 千葉 |
| 41 | 伊東真一 | 2:19:12 | 筑波 |
| 42 | 飯塚靖 | 2:20:36 | 慶應義塾 |
| 43 | 田中正人 | 2:20:55 | 筑波 |
| 44 | 斎藤市和 | 2:22:09 | 千葉 |
| 45 | 清水伸好 | 2:23:27 | 慶應義塾 |
| 46 | 池田俊彦 | 2:24:02 | 金沢 |
| 47 | 坪内正英 | 2:29:15 | 立命館 |
| 48 | 高井克実 | 2:31:32 | 大阪市立 |
| 49 | 小林毅 | 2:32:42 | 北海道 |
| 50 | 菅原琢 | 2:34:14 | 東邦 |
| 51 | 西村隆 | 2:38:04 | 早稲田 |
| 52 | 梅田芳樹 | 2:40:14 | 東京学芸 |
| 53 | 玉井幸治 | 2:41:49 | 京都 |
| 54 | 勝部浩介 | 2:42:42 | 山口 |
| 55 | 水原日出一 | 2:44:31 | 京都 |
| 56 | 大西康弘 | 2:45:07 | 神戸 |
| 57 | 小林直樹 | 2:47:13 | 中央 |
| 58 | 辻村歩 | 2:53:49 | 京都 |
| 59 | 北川達也 | 2:54:18 | 京都産業 |
| 60 | 香取伸嘉 | 2:55:00 | 千葉 |
| 61 | 中島秀之 | 2:56:03 | 大阪学院 |
| 62 | 山本賀彦 | 2:56:39 | 千葉 |
| 佐藤俊治 | 3:16:49 | 図書館情報 | |
| 上田裕史 | 3:26:26 | 防衛医科 | |
| 山崎清 | 3:29:05 | 名古屋 | |
| 枝垣佳久 | 4:05:48 | 龍谷 | |
| 小林達郎 | 4:08:04 | 新潟 | |
| 小野田敦 | 4:23:33 | 金沢 | |
| 森竜生 | DNF | 立教 | |
| 山本浩 | DNF | 山口 | |
| 番場俊文 | DNF | 文教 | |
| 植木成作 | DNF | 信州 | |
| 船木康弘 | DNF | 東京外国語 | |
| 山田勉 | DNF | 東京理科 | |
| 本山肇 | DNF | 上智 | |
| 大塚直樹 | DNF | 法政 | |
| 門田耕治 | DNF | 関西 | |
| 斉藤昌孝 | DNF | 東海 | |
| 大居利彦 | DNF | 東京工業 | |
| 室田直紀 | DNF | 京都府立 | |
| 星井嘉信 | DNF | 山口 | |
| 中井清人 | DNF | 愛知 | |
| 伊藤桂一 | DNF | 三重 | |
| 田中正人 | DNF | 東京工業高等専門学校 |