| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 樋口 佳和 | 0:43:41 | 東京農業大学 |
| 2 | 纓坂 尚 | 0:48:26 | 早稲田大学 |
| 3 | 田中 淳一 | 0:50:07 | 東京工業大学 |
| 4 | 後藤 崇 | 0:52:02 | 東京大学 |
| 5 | 浜端 紀行 | 0:53:12 | 東京大学 |
| 6 | 徳江 勇樹 | 0:54:45 | 東京工業大学 |
| 7 | 青島 健太 | 0:55:08 | 早稲田大学 |
| 8 | 福田 大輔 | 0:55:40 | 東京大学 |
| 9 | 井ノ川 智史 | 0:57:56 | 東京工業大学 |
| 10 | 柴田 寛士 | 0:58:06 | 早稲田大学 |
| 11 | 田所 真之 | 0:58:56 | 東京農工大学 |
| 12 | 古川 健二 | 1:00:55 | 千葉大学 |
| 13 | 高石 哲 | 1:01:17 | 慶應義塾大学 |
| 14 | 永井 悠文 | 1:02:30 | 筑波大学 |
| 15 | 藤野 真一 | 1:03:09 | 中央大学 |
| 16 | 牧山 知彦 | 1:03:10 | 東京大学 |
| 17 | 益本 宇一郎 | 1:03:39 | 東京大学 |
| 18 | 榊原 幸一郎 | 1:04:31 | 東京農工大学 |
| 19 | 櫻田 隆之 | 1:04:41 | 筑波大学 |
| 20 | 熊野 匠人 | 1:05:19 | 東京大学 |
| 21 | 石関 圭志 | 1:06:23 | 千葉大学 |
| 22 | 米田 稔 | 1:06:53 | 東京都立大学 |
| 22 | 小田 尚徹 | 1:06:53 | 早稲田大学 |
| 24 | 山本 俊光 | 1:07:12 | 東京大学 |
| 25 | 飯泉 祐司 | 1:08:01 | 千葉大学 |
| 26 | 吉本 正 | 1:08:06 | 国際基督教大学 |
| 27 | 石井 秀一 | 1:08:16 | 東京農工大学 |
| 28 | 村澤 良 | 1:08:35 | 東京大学 |
| 29 | 藤野 友祐 | 1:08:47 | 東京工業大学 |
| 30 | 井上 博人 | 1:08:56 | 東京農工大学 |
| 31 | 鷹觜 和邦 | 1:10:27 | 東京工業大学 |
| 32 | 湯川 康太郎 | 1:10:49 | 千葉大学 |
| 33 | 岩田 淳 | 1:11:08 | 東京工業大学 |
| 34 | 成田 充 | 1:11:21 | 図書館情報大学 |
| 35 | 野口 和範 | 1:13:35 | 東京大学 |
| 36 | 矢野 巧 | 1:14:30 | 中央大学 |
| 37 | 林 真輝 | 1:15:45 | 東京農工大学 |
| 38 | 佐藤 充 | 1:16:49 | 図書館情報大学 |
| 39 | 坪居 大介 | 1:18:02 | 東京工業大学 |
| 40 | 坂田 健一郎 | 1:19:47 | 千葉大学 |
| 41 | 青木 孝道 | 1:21:20 | 東京大学 |
| 42 | 佐伯 貴央 | 1:21:50 | 千葉大学 |
| 43 | 川口 大貴 | 1:23:52 | 茨城大学 |
| 44 | 加登屋 毅 | 1:24:56 | 早稲田大学 |
| 45 | 田村 優輝 | 1:26:34 | 東京大学 |
| 46 | 新井 啓史 | 1:27:57 | 東京大学 |
| 47 | 渡辺 真人 | 1:30:11 | 東京大学 |
| 48 | 高崎 裕一 | 1:31:26 | 埼玉大学 |
| 49 | 深井 太志 | 1:34:00 | 千葉大学 |
| 50 | 宮澤 陽介 | 1:35:00 | 一橋大学 |
| 51 | 川口 智明 | 1:35:46 | 中央大学 |
| 52 | 杉 道太郎 | 1:36:47 | 電気通信大学 |
| 53 | 市原 孝一 | 1:37:34 | 東京農工大学 |
| 54 | 岡本 淳 | 1:38:48 | 東京工業大学 |
| 55 | 山下 貴史 | 1:39:33 | 東京農業大学 |
| 56 | 土井 綾介 | 1:39:35 | 立教大学 |
| 57 | 大藤 弘典 | 1:39:43 | 茨城大学 |
| 58 | 河嶋 純平 | 1:39:53 | 筑波大学 |
| 59 | 友永 幸太 | 1:42:44 | 東京農工大学 |
| 60 | 阿部 宗徳 | 1:45:43 | 図書館情報大学 |
| 61 | 喜友名 剛 | 1:51:17 | 大東文化大学 |
| 62 | 小泉 将史 | 1:55:40 | 立教大学 |
| 63 | 八木沼 俊 | 1:57:51 | 早稲田大学 |
| 64 | 中野 眞治 | 2:00:55 | 立教大学 |
| 65 | 荒井 俊昭 | 2:03:05 | 東京工業大学 |
| 66 | 岡野 諭 | 2:07:46 | 東京大学 |
| 67 | 大浅 殖央 | 2:14:24 | 東京農工大学 |
| 68 | 小林 洋平 | 2:21:57 | 立教大学 |
| 69 | 大東 秀昭 | 2:27:22 | 慶應義塾大学 |
| (70) | 白柳 和樹 | 2:32:06 | 筑波大学 |
| (71) | 佐藤 励 | 3:02:19 | 中央大学 |
| 池田 純也 | P6 | 立教大学 | |
| 広津 敏尚 | DNF | 東京工業大学 | |
| 今村 昌平 | DNF | 立教大学 | |
| 谷口 晃平 | DNF | 東京農工大学 | |
| 筑後 昌英 | DNF | 埼玉大学 | |
| 栗林 大輔 | DNF | 早稲田大学 |