| 順位 | 氏名 | 記録 | 所属 |
|---|---|---|---|
| 1 | 禅洲 拓 | 1:24:47 | 東北4 |
| 2 | 西尾 信寛 | 1:25:51 | 京都4 |
| 3 | 吉田 武生 | 1:25:55 | 京都3 |
| 4 | 小熊 武彦 | 1:28:49 | 東京3 |
| 5 | 浜田 尚 | 1:29:19 | 東北2 |
| 6 | 李 敬史 | 1:29:22 | 静岡3 |
| 7 | 久野 雄介 | 1:29:49 | 東京3 |
| 8 | 新宅 有太 | 1:30:57 | 京都3 |
| 9 | 蔵田 真彦 | 1:30:59 | 東京工業4 |
| 10 | 櫻本 信一郎 | 1:32:05 | 東北3 |
| 11 | 青木 博人 | 1:32:28 | 東京3 |
| 12 | 小部 直人 | 1:32:30 | 筑波4 |
| 13 | 樋口 佳和 | 1:32:51 | 東京農業3 |
| 14 | 知念 毅 | 1:34:27 | 早稲田4 |
| 15 | 吉田 靖 | 1:35:17 | 大東文化4 |
| 16 | 鈴木 健朗 | 1:35:29 | 金沢4 |
| 17 | 鉾立 裕樹 | 1:35:49 | 東北1 |
| 18 | 堀江 守弘 | 1:36:55 | 東北3 |
| 19 | 小林 恭輔 | 1:36:59 | 東北2 |
| 20 | 纓坂 尚 | 1:37:18 | 早稲田3 |
| 21 | 小野田 剛太 | 1:37:45 | 京都2 |
| 22 | 川上 崇史 | 1:38:55 | 慶應義塾2 |
| 23 | 寺垣内 航 | 1:39:30 | 早稲田3 |
| 24 | 楠本 俊壮 | 1:40:31 | 京都2 |
| 25 | 佐々木 良宜 | 1:41:08 | 筑波4 |
| 26 | 宇田川 雅令 | 1:42:14 | 東京4 |
| 27 | 岡野 健太郎 | 1:42:59 | 京都4 |
| 28 | 佐野 智人 | 1:43:31 | 北海道4 |
| 29 | 山田 雄一郎 | 1:44:55 | 早稲田4 |
| 30 | 尾島 良 | 1:45:57 | 大阪3 |
| 31 | 樋山 邦治 | 1:48:13 | 東北2 |
| 32 | 青島 健太 | 1:48:17 | 早稲田4 |
| 33 | 後藤 崇 | 1:48:25 | 東京4 |
| 34 | 脇野 昌太郎 | 1:48:40 | 図書館情報4 |
| 35 | 天谷 翔吾 | 1:49:22 | 金沢2 |
| 36 | 田中 淳一 | 1:50:23 | 東京工業3 |
| 37 | 益本 宇一郎 | 1:51:02 | 東京2 |
| 38 | 周藤 博之 | 1:51:03 | 東北4 |
| 38 | 内藤 愉孝 | 1:51:03 | 静岡3 |
| 40 | 安藤 誠 | 1:52:53 | 東京3 |
| 41 | 森下 隼人 | 1:55:07 | 慶應義塾4 |
| 42 | 櫻田 隆之 | 1:55:16 | 筑波3 |
| 43 | 樺沢 直行 | 1:56:36 | 新潟3 |
| 44 | 山本 昇平 | 1:58:45 | 京都4 |
| 45 | 菊澤 恵三 | 1:59:43 | 東京工業4 |
| 46 | 西岡 利泰 | 2:00:43 | 北海道3 |
| 47 | 安田 太郎 | 2:00:53 | 埼玉2 |
| 48 | 松井 宏介 | 2:01:41 | 立命館4 |
| 49 | 牧山 知彦 | 2:03:54 | 東京2 |
| 50 | 松室 隼人 | 2:07:05 | 金沢2 |
| 51 | 森川 佳太 | 2:09:10 | 山口2 |
| 52 | 中村 貴史 | 2:14:54 | 大阪市立3 |
| 徳江 勇樹 | DISQ | 東京工業3 | |
| 小笠原 隆史 | DISQ | 新潟3 | |
| 高橋 大輔 | DISQ | 神戸3 | |
| 笹谷 淳一 | DISQ | 金沢4 | |
| 松本 伸也 | DISQ | 山口3 | |
| 岩本 俊哉 | DISQ | 山口2 | |
| 三宅 文彦 | DISQ | 名古屋2 | |
| 吉本 正 | DISQ | 国際基督教4 |